CTCF Gel Shift Oligonucleotides: sc-2613
- consensus binding site for the CTCF transcription factor; supplied as 500 ng double-stranded DNA; sc-2613
- also available as mutant oligonucleotide with "GCCGCT"→"TAATAG" in CTCF binding motif; sc-2614
- 5'-GGC GGC GCC GCT AGG GGT CTC TCT-3'
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説明
データシートとプロトコル
関連項目
CTCFゲルシフトオリゴヌクレオチドは、タンパク質-DNA相互作用の精査を目的とした分子生物学研究の基礎技術であるゲルシフトアッセイに応用するために複合合成された短いDNA配列である。CTCFはCCCTC-binding factorの略で、転写調節、クロマチン組織化、ゲノムインプリンティングなど多様な細胞内プロセスに関与する高度に保存された転写因子である。CTCFは、ゲノム内のCTCF結合部位またはインシュレーター配列として知られる特定のDNA配列に結合し、クロマチン構造を調節し、離れたゲノム領域間の長距離相互作用を促進することにより、遺伝子発現の万能な調節因子として働く。CTCFゲルシフトオリゴヌクレオチドをゲルシフトアッセイに用いることで、研究者は様々な実験条件下で、CTCFの標的DNA配列への結合速度、特異性、親和性を調べることができる。この手法により、CTCFを介した遺伝子制御の根底にある分子メカニズムの解明が可能になり、ゲノムの複雑な構造組織についての洞察が得られる。
参考文献:
- フリードライヒ失調症におけるエピジェネティックサイレンシングは, CTCF（CCCTC結合因子）の枯渇とアンチセンス転写に関連している。 | De Biase, I., et al. 2009. PLoS One. 4: e7914. PMID: 19956589
- ブタADRB2遺伝子の発現を制御するシス制御エレメントの同定と機能的特徴づけ。 | Jaeger, A., et al. 2015. Int J Biol Sci. 11: 1006-15. PMID: 26221068
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
CTCF consensus oligonucleotide | sc-2613 | 500 ng/25 µl | $49.00 | |||
CTCF mutant oligonucleotide | sc-2614 | 500 ng/25 µl | $49.00 |