ChIP Elution Buffer
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ChIP Elution Bufferは、クロマチン内のタンパク質-DNA相互作用を調べるための分子生物学研究において極めて重要な手法であるクロマチン免疫沈降（ChIP）アッセイに使用される専用溶液です。このバッファーは、ChIP手順中に免疫沈降されたタンパク質-DNA複合体を効率的に遊離・回収するために細心の注意を払って調合されています。ChIP溶出バッファーには通常、Tris-HClとエチレンジアミン四酢酸（EDTA）、および様々な濃度の塩化ナトリウム（NaCl）またはその他の塩が含まれます。Tris-HClはpHを安定に保つ緩衝剤として機能し、EDTAは二価陽イオンをキレートしてタンパク質-DNA相互作用を破壊し、クロマチン複合体の遊離を促進する。NaClやその他の塩の添加は、タンパク質-DNA複合体の抗体からの解離を促進することで溶出条件を最適化し、標的DNA断片の回収を向上させる。ChIP実験では、タンパク質-DNA複合体を免疫沈降させた後、ChIP Elution Bufferを使用してこれらの複合体を抗体から溶出または遊離させる。このステップは、定量ポリメラーゼ連鎖反応（qPCR）、次世代シークエンシング（NGS）、マイクロアレイ解析などの技術で分析可能な精製DNA断片を得るために極めて重要である。溶出ステップの効率は、下流の解析の感度と精度に直接影響するため、ChIP溶出バッファーがChIPアッセイの重要な構成要素となっている。研究者は、バックグラウンドノイズや非特異的結合を最小限に抑えながらDNA断片の回収率を最大化するために、ChIP Elution Bufferの組成や条件を最適化することが多い。バッファーpH、塩濃度、溶出温度などの様々な要因が、溶出効率や回収DNAの品質に影響を与える可能性があります。さらに、ChIP Elution Bufferは、低存在量のDNA断片の回収や、その後の解析のためのタンパク質-DNA相互作用の保存など、特定の用途や実験要件に合わせて調整することができる。ChIP Elution BufferはChIP実験において重要な役割を果たし、免疫沈降したタンパク質-DNA複合体を効率的に回収し、タンパク質-DNA相互作用に関する信頼性の高いデータを得ることができます。最適化された処方と厳格な溶出条件は、ChIPアッセイの成功とクロマチン生物学および遺伝子制御メカニズムの理解の進展に貢献しています。
ChIP Elution Buffer 参考文献
- 生体内でのRNA-タンパク質結合を決定するためのRNA免疫沈降法。 | Gilbert, C. and Svejstrup, JQ. 2006. Curr Protoc Mol Biol. Chapter 27: Unit 27.4. PMID: 18265380
- クロマチン免疫沈降法とオリゴヌクレオチドタイリングアレイ（ChIP-Chip）を組み合わせた機能的ゲノム研究。 | Eeckhoute, J., et al. 2009. Methods Mol Biol. 556: 155-64. PMID: 19488877
- ゲノムワイドなタンパク質-DNA相互作用解析：ChIP-chip | Tong, Y. and Falk, J. 2009. Methods Mol Biol. 590: 235-51. PMID: 19763508
- ChIP-seq技術を用いてヒストン修飾の高分解能プロファイルを作成する。 | O'Geen, H., et al. 2011. Methods Mol Biol. 791: 265-86. PMID: 21913086
- DNA結合タンパク質のゲノム上の位置を一塩基に近い精度で同定するChIP-exo法。 | Rhee, HS. and Pugh, BF. 2012. Curr Protoc Mol Biol. Chapter 21: Unit 21.24. PMID: 23026909
- ショウジョウバエのイマジナルディスクからのHoxタンパク質のChIP。 | Agrawal, P. and Shashidhara, LS. 2014. Methods Mol Biol. 1196: 241-53. PMID: 25151168
- クロマチン免疫沈降法を用いた植物転写因子の細胞種特異的DNA結合部位の同定。 | Lau, OS. 2017. Methods Mol Biol. 1629: 37-45. PMID: 28623578
- MOBE-ChIP：大規模クロマチン免疫沈降法による細胞種特異的結合のプローブ。 | Wang, S. and Lau, OS. 2018. Methods Mol Biol. 1689: 167-176. PMID: 29027174
- 二価のエピジェネティック修飾をプロファイリングするためのシーケンシャルChIPプロトコル（ReChIP）。 | Desvoyes, B., et al. 2018. Methods Mol Biol. 1675: 83-97. PMID: 29052187
- ChIP-seqアプリケーションにおけるナノグラム範囲の免疫沈降DNAの精製。 | Zhong, J., et al. 2017. BMC Genomics. 18: 985. PMID: 29268714
- Xenopus卵抽出物におけるプラスミド結合タンパク質のクロマチン免疫沈降（ChIP）。 | Wolfe, KB. and Long, DT. 2019. Methods Mol Biol. 1999: 173-184. PMID: 31127576
- ChIP-Seqによるヒストン修飾のゲノムワイドプロファイリング。 | Ricci, WA., et al. 2020. Methods Mol Biol. 2072: 101-117. PMID: 31541441
- AutoRELACS：超並列ChIP-seqの自動生成と解析。 | Arrigoni, L., et al. 2020. Sci Rep. 10: 12400. PMID: 32709929
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| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
ChIP Elution Buffer, 30 ml | sc-45003 | 30 ml | $26.00 |