ALKBH3 Double Nickaseプラスミド (h): sc-406896-NIC
- 対象生物種: human
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- ALKBH3 Double Nickaseプラスミド (h)はペアのプラスミドを含みます。それぞれのプラスミドはD10A変異したCas9 nuclease、及びCRISPR/Cas9 KOの対応よりも高い特異性で遺伝子発現をノックアウトするように設計された標的特異的な20 ntガイドRNA (gRNA)をコードします。
- ペアリングしたガイドRNAは、約20 bpでずらすことにより、ゲノムDNAの特定Cas9媒介のdouble nickingを可能にし、DSBを模造します。
- ペアの1つのプラスミドは選択用のピューロマイシン耐性遺伝子を含みます；ペアのほかの1つのプラスミドは、視覚的にトランスフェクションを確認するGFPマーカーを含みます。
- ALKBH3ダブルニカースプラスミド（h）およびALKBH3ダブルニカースプラスミド（h2）は、ALKBH3を標的とする異なるペアのgRNA設計をコードしています。いずれか一方、あるいは両方のデザインが利用可能である場合があります
- トランスフェクションの後、遺伝子ノックアウト効果は、抗体を用いたWB、IFまたはIHCによって検定されることができます: ALKBH3 抗体 (B-7): sc-376520
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
ALKBH3 Double Nickaseプラスミド (h) | sc-406896-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
ALKBH3 Double Nickaseプラスミド (h2) | sc-406896-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
ALKBH3（AlkB homolog 3）は、ヒトのFe(II)/2-オキソグルタル酸依存性ジオキシゲナーゼであり、アルキル化された核酸の酸化的脱メチル化を触媒します。これにより、DNAおよびRNAに生じる1-メチルアデニンや3-メチルシトシンなどの損傷の修復に寄与します。この活性はゲノム維持とRNA品質管理を支え、DNA損傷応答経路や複製に伴うストレスとも交差します。ALKBH3の発現異常やアルキル化損傷修復能の変化は、複数のがん関連の状況で報告されており、核酸修復や転写の忠実性への依存が増殖表現型に影響し得ます。その結果、ALKBH3は、アルキル化損傷耐性の機構、Rループおよび転写関連の不安定性、ならびに遺伝毒性ストレス因子に対する細胞応答の研究において頻繁に取り上げられています。
ALKBH3 ダブルニカースプラスミド（h）は、human 細胞株における ALKBH3 座の高特異性編集のために設計された、対となる2つのプラスミドから構成される。各プラスミドは、Cas9 D10Aニカースと、ALKBH3内の対向するDNA鎖を標的とする異なるsgRNAを発現する。対向するDNA鎖上の隣接する部位に誘導されると、2つのニカースはオフセットした一本鎖切断を生成し、これらが組み合わさってずれた二本鎖切断を生じさせる。これにより、両方のガイドによる協調的なオンターゲット活性が必要となる。生じたDNA切断は、細胞内の内在性修復経路、特に非相同末端結合（NHEJ）によって修復され、その結果、ALKBH3の機能を阻害する挿入または欠失が生じる。標的座標における2つのsgRNAの結合を必要とするこの二重ニッキング法は、編集の特異性を高め、標的精度に対するさらなる制御が求められる用途において、CRISPR戦略を補完するものである。
編集された細胞を効率的に同定するために、1つのプラスミドはトランスフェクトされた細胞集団を蛍光可視化するためのGFPをコードし、もう1つのプラスミドは抗生物質選別用のプロマイシン耐性遺伝子を保有しています。これらの機能により、共トランスフェクトされた細胞集団の効率的な濃縮が可能となり、ALKBH3が破壊されたクローンの検証が簡素化されます。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。