ZNF146の化学的阻害剤は、様々な生化学的経路を介して作用し、その機能を阻害することができる。スタウロスポリンは、ZNF146がその活性を依存するリン酸化過程に不可欠なプロテインキナーゼを阻害することによって作用する。この阻害は、遺伝子発現におけるZNF146の役割を制御する正常なリン酸化依存性制御機構を崩壊させる。同様に、PP2は、ZNF146が関与するシグナル伝達経路に不可欠なSrcファミリーキナーゼを標的とし、その結果、これらの経路におけるZNF146の機能が損なわれる。PD168393は、EGFRキナーゼを不可逆的に阻害することによってその効果を発揮し、ZNF146が関与する経路の下流での阻害につながり、外部刺激に対する細胞応答を媒介する役割を阻害する。LY294002とWortmanninはPI3K阻害剤として機能し、様々なシグナル伝達カスケード、特に細胞増殖と生存を支配するシグナル伝達カスケードにおけるZNF146の活性にとって重要なリン酸化事象を減少させることができる。
これらに加えて、U0126とPD98059は、MAPK/ERK経路の上流制御因子であるMEKを阻害することに重点を置いており、そのシグナル伝達カスケードにはZNF146が関与していることが知られている。その結果、ERKの活性化が抑制され、外部シグナルに応答した遺伝子発現の変化を媒介するZNF146の機能が低下する。JNK阻害剤SP600125は、ZNF146のシグナル伝達経路への関与の下流効果であるAP-1転写因子活性を変化させ、ZNF146の機能抑制につながる。SB203580は、p38 MAPキナーゼを阻害することにより、ストレス応答シグナル伝達におけるZNF146の役割に影響を与えることができる。ROCK阻害剤であるY-27632は、細胞骨格ダイナミクスを変化させることができ、これは遺伝子制御における役割のためにZNF146が影響を及ぼす可能性のあるプロセスである。プロテインキナーゼC阻害剤であるGF109203Xは、ZNF146が関与するシグナル伝達経路や細胞内プロセスを変化させ、その機能阻害につながる。最後に、LFM-A13はBrutonチロシンキナーゼを標的とし、ZNF146が機能することが知られているシグナル伝達経路に影響を与え、これらの文脈におけるタンパク質の活性を阻害する。
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