ZBTB3は、タンパク質のリン酸化状態を調節する様々な細胞内シグナル伝達経路を通じて、その活性に影響を与えることができる。フォルスコリンは、アデニル酸シクラーゼを直接刺激することで、細胞内のcAMPレベルを上昇させ、次にプロテインキナーゼA(PKA)を活性化する。この活性化により、細胞内のタンパク質がリン酸化され、その機能や相互作用が変化する。ZBTB3の文脈では、ZBTB3がPKAの基質であるか、またはその活性がPKAを介したリン酸化によって調節されている場合、フォルスコリンの作用はZBTB3の活性化をもたらすであろう。同様に、細胞透過性のcAMPアナログであるジブチリル-cAMPもPKAを活性化し、ZBTB3のリン酸化とそれに続く活性化につながる可能性がある。ホスホジエステラーゼを阻害するIBMXのような化合物は、cAMPの分解を妨げることによって間接的にPKAの活性化を促進し、その結果、PKAの活性を持続させ、ZBTB3の活性化に影響を及ぼす可能性がある。
他の化合物は、カルシウムシグナルが関与する異なるメカニズムでZBTB3を活性化する。カルシウムイオノフォアであるイオノマイシンとA23187は、いずれも細胞内カルシウムレベルを上昇させ、ZBTB3活性を修飾することができる様々なカルシウム依存性タンパク質を活性化する可能性がある。FPL 64176とタプシガルギンもまた細胞内カルシウム濃度を上昇させるが、FPL 64176はカルシウムチャネルを活性化することによって、タプシガルギンはサルコ/小胞体Ca2+-ATPase(SERCA)を阻害することによってカルシウム濃度を上昇させる。上昇したカルシウムは、ZBTB3のリン酸化や他の翻訳後修飾につながる下流のシグナル伝達カスケードを引き起こす。PMAやTPAのようなホルボールエステルは、プロテインキナーゼC(PKC)を活性化し、ZBTB3の活性を制御する基質をリン酸化する。さらにオカダ酸は、プロテインホスファターゼPP1およびPP2Aを阻害することによって、細胞内のタンパク質のリン酸化レベルを上昇させ、ZBTB3またはその制御タンパク質を含む可能性があり、それによってその活性を調節する。逆に、PKC阻害剤であるBIMは、ある濃度ではPKCを活性化することもでき、このような二重活性が、リン酸化事象を介したZBTB3の活性化に関係している可能性がある。
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