WDR42B阻害剤には、特定のシグナル伝達経路または分子プロセスを標的とすることにより、WDR42Bの機能的活性を間接的に減弱させる多様な化合物が含まれる。例えば、WDR42Bの活性は、キナーゼシグナル伝達カスケードを破壊する阻害剤によって低下させることができる;このような阻害は、下流のシグナル伝達におけるWDR42Bの役割にとって重要なリン酸化事象の防止によって起こり得る。これには、WDR42Bが調節機能を持つと考えられるMAPキナーゼ経路の調節が含まれ、WDR42Bに関連するエフェクタータンパク質の活性に影響を与える。同様に、PI3K/AktおよびMEK/ERK経路は、様々な細胞機能に不可欠であり、これらのキナーゼを阻害する化合物は、WDR42Bが下流のエフェクターである場合、WDR42Bの活性を低下させ、それによってこれらのシグナル伝達事象に対するWDR42Bの機能的寄与を妨げる可能性がある。さらに、JNKシグナル伝達を標的とする阻害剤は、WDR42BがJNK制御過程に関与している場合、WDR42Bの活性を低下させ、この経路によって媒介される細胞応答を低下させる可能性がある。
さらに間接的な阻害は、キナーゼ活性以外の細胞内プロセスやシグナル伝達ネットワークを不安定化する化合物から生じる。例えば、細胞の運命決定や増殖に重要な役割を果たすヘッジホッグ経路やWntシグナル伝達経路を破壊すると、WDR42Bが直接関与するか、その構成成分の調節を介して、これらの経路で役割を果たしている場合、WDR42B活性の低下につながる可能性がある。ノッチ経路阻害剤もまた、ノッチ受容体の活性化に極めて重要なガンマセクレターゼ複合体に影響を与えることによって、WDR42B活性を低下させる可能性がある。細胞の増殖と代謝に不可欠なmTOR経路の阻害も、もしこのタンパク質がこの経路の下流成分または調節因子であれば、同様にWDR42Bの活性を低下させる可能性がある。
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