WDR31の阻害剤は、タンパク質そのものを直接標的とすることなく、WDR31が関与する様々なシグナル伝達経路や細胞プロセスを調節することによって機能する。例えば、mTORシグナル伝達の阻害は、タンパク質合成と細胞増殖の減少につながり、WDR31がこれらの細胞プロセスに関与している場合、間接的にWDR31の機能的活性を低下させる。同様に、細胞の生存に重要な経路であるPI3K/ACT/mTORカスケードの阻害は、これらの生存機構を導くシグナルを阻害することにより、WDR31が機能的に関連する活性の低下につながる可能性がある。MEK阻害剤の使用は、細胞増殖と生存に関与するMAPK/ERK経路に影響を与え、細胞シグナル伝達の動態を変化させ、これらの経路におけるWDR31の機能的役割に影響を与える可能性がある。p38 MAPKの阻害は、アポトーシスだけでなく、ストレスや炎症反応にも影響するため、これらの細胞反応に関連するWDR31の機能に影響を与える。さらに、JNKシグナル伝達経路が阻害されると、アポトーシスや他の細胞プロセスに影響を及ぼし、その結果、これらの経路内でのWDR31の役割を修正する可能性がある。
他の阻害剤は、WDR31がその一端を担っていると思われる、より特殊な細胞内状況に関与する経路を標的としている。例えばシクロパミンは、細胞の分化と組織のパターニングに不可欠なヘッジホッグ経路を阻害し、これらの生物学的過程におけるWDR31の機能的役割に影響を与える。VEGFRの阻害剤は、血管新生と細胞移動に重要なVEGF経路を阻害し、関連する現象におけるWDR31の活性を変化させる可能性がある。さらに、特異的な阻害剤によるRho/ROCK経路のターゲティングは、細胞骨格動態と細胞運動に影響を与え、間接的にWDR31活性に影響を与える。
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