UGT2A1の化学的阻害剤には、活性部位に結合したり、グルクロン酸抱合活性を阻害するように酵素と相互作用する様々なフラボノイドやポリフェノール化合物が含まれる。例えば、クリシンはフラボノイドの一種で、UGT2A1の基質と酵素の結合部位を競合し、基質の抱合を効果的に阻害する。ナリンゲニンも同様の働きをし、UGT2A1の活性部位を占有することで基質へのアクセスを阻害し、酵素活性を阻害する。バイカレインの阻害作用は、UGT2A1との直接的な相互作用によるもので、酵素の触媒効率を低下させる構造変化を引き起こす。もう一つの強力なフラボノイドであるケルセチンは、立体障害を引き起こすことでUGT2A1を阻害し、天然基質と酵素の結合を阻害する。ウォゴニンは、直接的な相互作用によってUGT2A1の構造や機能を変化させ、グルクロン酸分解活性を低下させる。
さらに、カエンフェロールとエピカテキンは、活性部位に結合して天然基質が酵素と相互作用するのを妨げる競合阻害によって、UGT2A1を阻害することができる。一方、クルクミンは、結合時にUGT2A1の構造変化を引き起こし、基質のグルクロン酸抱合を触媒する酵素の能力を低下させる。ミリセチンはUGT2A1と直接相互作用し、活性部位を変化させ、基質との相互作用を低下させる。ゲニステインは、活性部位をブロックすることでUGT2A1を阻害し、酵素が通常のグルクロン酸化反応を行うのを妨げる。レスベラトロールの阻害方法は、UGT2A1の活性部位に結合し、天然基質との競合阻害によって活性を低下させる。最後に、エラグ酸はUGT2A1の活性部位に結合することができ、その結果、天然基質に対する親和性が低下し、酵素のグルクロン酸化機能が低下する。
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