Syne-4活性化因子は、主にアクチン細胞骨格形成に関与するタンパク質のリン酸化状態に影響を与えることによって作用するが、この過程においてSyne-4は重要な役割を果たしている。フォルスコリンやIBMXを含むいくつかの活性化剤は、細胞内のcAMPレベルを上昇させ、その後プロテインキナーゼA(PKA)を活性化する。活性化されたPKAは、アクチン細胞骨格構成に関与するタンパク質をリン酸化し、間接的にSyne-4の活性を高める。もう一つの活性化因子であるアニソマイシンは、アクチン細胞骨格形成に関与するストレス活性化プロテインキナーゼ(SAPK)/JNK経路を引き起こし、間接的にSyne-4の機能を増強する。膜透過性cAMPアナログであるジブチリル-cAMPは、PKAを活性化することによって同様の効果を達成する。
ある種のSyne-4活性化剤は、タンパク質リン酸化酵素を阻害し、アクチン細胞骨格構成に関与するタンパク質のリン酸化状態を維持することによって働く。オカダ酸とカリクリンAはプロテインホスファターゼ1と2Aを阻害し、それによって間接的にSyne-4の活性状態を維持し、その役割を高める。ホスファターゼの一つであるカルシニューリンの阻害剤であるシクロスポリンAも同様の働きをする。H-89、スタウロスポリン、ラパマイシン、塩化リチウムのような他の活性化剤は、アクチン細胞骨格の構成に関与するタンパク質のリン酸化に影響を与えることができる異なるキナーゼに影響を与え、このプロセスにおけるSyne-4の役割を間接的に高める。
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