SRP54a アクチベーター

一般的なSRP54a活性化剤には、グアノシン-5'-三リン酸二ナトリウム塩CAS 86-01-1、塩化マグネシウムCAS 7786-30-3、L-メチオニンCAS 63-68-3、 メチオニン CAS 63-68-3、フッ化ナトリウム CAS 7681-49-4、および無水塩化アルミニウム CAS 7446-70-0。

SRP54aの化学的活性化因子は、シグナル認識粒子（SRP）経路におけるSRP54aの機能的動態において重要な役割を果たしている。GTPは直接活性化因子としてSRP54aに結合し、その活性化に必要なエネルギーを供給し、リボソーム-前駆鎖複合体の小胞体へのターゲティングを開始する。GTPの結合は、SRP54aが新しく合成されたタンパク質のシグナル配列と結合するきっかけとなる重要なイベントであり、タンパク質を細胞の適切な目的地へと効果的に導く。塩化マグネシウムは、SRP54aが適切に機能するために不可欠なSRP複合体の構造的完全性を維持することによって、このプロセスをサポートしている。メチオニンはもう一つの活性化因子であり、SRP54aは新生ポリペプチド中のメチオニンに富んだシグナル配列を認識し、SRP依存的な標的化機構を活性化する。

SRP54aの活性化にさらに影響を与えるのは、GDPがGTPに置き換わることによってGTPaseサイクルの役割を果たし、SRP54aが再び活性化される準備をすることである。フッ化ナトリウムは、そのGTPアーゼ活性を阻害することによりSRP54aの活性化を維持し、タンパク質の不活性化を防ぐ。同様に、非加水分解性GTPアナログであるグアニルイミドジホスフェートはSRP54aに結合し、タンパク質の活性状態を維持する。これはグアノシン5'-O-(3-チオトリホスフェート)にも当てはまる。グアノシン5'-O-(3-チオトリホスフェート)はGTPの代わりにSRP54aに結合するが、加水分解に抵抗性であるため、タンパク質を活性状態に維持する。リシルtRNAは翻訳機構の重要な構成要素であり、リボソーム-前駆鎖複合体との相互作用がタンパク質の効率的な標的化に必要であるため、リシルtRNAの存在はSRP54aの活性を高める。さらに、塩化アルミニウムはGTPの模倣物質として働き、活性状態を模倣する構造変化を誘導することでSRP54aを活性化する可能性がある。グアノシン5'-二リン酸は、GDPと競合することによってSRP54aの活性化に寄与し、GTPの結合とSRP54aの活性化に必要な交換を促進する。最後に、ウリジン5'-三リン酸は、特異性は低いものの、GTP結合タンパク質に結合することができ、同様のヌクレオチド交換のメカニズムによってSRP54aの活性化に寄与している可能性がある。