SPANX-N3の活性化は、細胞内での機能活性を高める様々な生化学的経路によって達成される。このようなメカニズムのひとつに、多くのシグナル伝達カスケードにおいて極めて重要なセカンドメッセンジャーである細胞内cAMPレベルの上昇がある。cAMPの上昇は、アデニル酸シクラーゼの活性化、あるいはホスホジエステラーゼの阻害によってもたらされ、その結果、プロテインキナーゼA(PKA)が活性化される。一旦活性化されると、PKAはSPANX-N3をリン酸化する可能性があり、このリン酸化は翻訳後修飾であり、一般的にタンパク質の機能を制御する役割を果たす。このカスケードは、アデニル酸シクラーゼを直接刺激したり、cAMPの分解を阻害したりする薬剤によって引き起こされる。さらに、cAMPの作用を模倣した薬剤は、PKAを直接活性化することができるため、上流の受容体やGタンパク質をバイパスし、SPANX-N3活性を増強する別のルートを提供する。
SPANX-N3活性化のもう一つの方法は、細胞内カルシウムレベルの調節である。カルシウムは普遍的なシグナル伝達分子として機能し、細胞内の濃度は細かく制御されている。カルシウムチャネルのイオノフォアまたはアゴニストとして作用する化合物は、カルシウムの流入を変化させ、カルシウム依存性プロテインキナーゼの活性化につながる。これらのキナーゼは、SPANX-N3を含む多くのタンパク質をリン酸化の標的とし、活性を高める。さらに、ジアシルグリセロールと細胞内カルシウムの増加に反応するキナーゼファミリーであるPKCの活性化も、多様な細胞内プロセスに関与するタンパク質のリン酸化をもたらす。
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