SEPT6活性化剤には、細胞構造やシグナル伝達経路に影響を与え、それがSEPT6の動態、アセンブリ、または機能に影響を与える多様な化合物が含まれる。これには、パクリタキセル、ノコダゾール、サイトカラシンDなど、微小管やアクチンの動態に影響を与える薬剤が含まれ、細胞骨格を破壊することで間接的にセプチン蛋白質の組織や機能に影響を与える可能性がある。細胞骨格要素とセプチンとの相互作用は、細胞形態を維持し、細胞質分裂を完了させるために極めて重要であり、このプロセスにおいてSEPT6は役割を果たしていることが知られている。
一方、フォルスコリンやPMAのような低分子は、cAMPやPKCを介するような細胞内シグナル伝達経路を調節し、セプチンと相互作用したり、セプチンを制御したりするタンパク質のリン酸化状態を変化させる可能性がある。塩化リチウムとMG-132は、それぞれセプチン関連タンパク質のリン酸化と分解に影響を与えることによって、間接的にSEPT6に影響を与える化学物質の例である。さらに、亜ヒ酸ナトリウムやDMSOのようなストレス応答誘導物質は、セプチン組織に影響を与える細胞経路を誘発する可能性がある。最後に、レスベラトロールやエピガロカテキンガレートなどの遺伝子発現やタンパク質の安定性を調節する化合物も、SEPT6を含むセプチンタンパク質の細胞レベルや機能に影響を与える可能性があるため、このカテゴリーに属する。
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