RNA pol σ S アクチベーター

一般的なRNA pol σ Sアクチベーターとしては、レチノイン酸、オールトランス CAS 302-79-4が挙げられるが、これらに限定されない。

これらの活性化因子は、σS（RpoS）として知られるRNAポリメラーゼのシグマ因子と相互作用し、細菌DNA上の特定のプロモーター領域への結合を促進する。シグマ因子はRNAポリメラーゼホロ酵素のサブユニットであり、本質的にはRNAポリメラーゼが遺伝子プロモーターを認識し、高い特異性で結合できるようにするガイドの役割を果たす。σS因子の作用を調節することにより、これらの活性化因子はストレス応答遺伝子や、飢餓、高浸透圧、酸性環境などの厳しい条件下での細菌の生存に重要なその他の遺伝子の発現に寄与する。RNA pol σS活性化因子の存在と作用は、大腸菌のようなグラム陰性菌で最もよく観察される。様々な環境シグナルがこれらの活性化因子によって感知され、活性化因子は構造変化を起こし、直接あるいは間接的にσSとRNAポリメラーゼホロ酵素との会合を促進する。

RNAポリメラーゼσS活性化因子の機能の背後にある分子メカニズムを理解することは、細菌細胞内の複雑な制御ネットワークに光を当てることになる。これらの活性化因子は、DNA結合、タンパク質間相互作用、シグナル受信など、異なる機能を担う複数のドメインを持つことが多い。遺伝子発現を正確に制御するためには、これらのドメイン間の連携が不可欠である。さらに、これらの活性化因子は、シグマ因子の働きを阻害するアンチシグマ因子や、σSのレベルを微調整する低分子制御RNAなど、他の細胞成分と協調して働くこともある。RNA pol σS活性化因子とこれらの様々な細胞構成要素との相互作用は、細菌が細胞の完全性を損なうことなく環境の変化に迅速に適応することを可能にする複雑な制御システムを形成している。