RLA-DQ阻害剤は、最終的にRLA-DQタンパク質の活性に影響を及ぼす様々なシグナル伝達経路や細胞内プロセスを阻害する多様な化合物群から構成されている。これらの阻害剤はRLA-DQに直接結合するのではなく、RLA-DQの機能と発現を制御するシグナル伝達カスケードの上流または下流にあるタンパク質や酵素に作用する。例えば、WortmanninやLY294002のような化合物はPI3Kの阻害剤であり、PI3KはRLA-DQに影響を与えるシグナル伝達経路を含む多くのシグナル伝達経路の活性化において重要な役割を果たす酵素である。PI3Kの阻害は、RLA-DQの適切な機能に必要なリン酸化事象の減少につながる。
さらに、mTOR、Srcファミリーキナーゼ、JNK、p38 MAPK、MEK、NF-κB、STAT3が関与する経路の阻害は、これらの化合物がRLA-DQの活性を変化させることができる、さらなるメカニズムを示している。例えば、ラパマイシンのmTORに対する作用は、RLA-DQの下流に影響を及ぼす重要な成長シグナル伝達経路を破壊する。同様に、PP2、SP600125、SB203580、PD98059、U0126などの化合物は、RLA-DQ活性の制御に重要な様々なキナーゼに影響を与える。BAY 11-7082とクルクミンは、RLA-DQの発現制御に関与しているNF-κB経路とSTAT3経路をそれぞれ調節することによって影響を及ぼす。さらに、2-デオキシ-D-グルコースは解糖プロセスに影響を与え、間接的にRLA-DQの機能性に影響を与える可能性がある。最後に、シクロスポリンAはカルシニューリン経路に作用し、T細胞の活性化に関与し、結果としてRLA-DQの機能を調節する可能性がある。それぞれの化合物は、独自のメカニズムにより、細胞内シグナル伝達環境を変化させたり、RLA-DQに関連する遺伝子発現パターンに影響を与えたりすることで、RLA-DQタンパク質の活性調節に寄与している。
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