RBMS3の化学的阻害剤は、このタンパク質が関与することが知られている様々なシグナル伝達経路や細胞プロセスを標的とすることができる。Marimastatはマトリックスメタロプロテアーゼを阻害することにより作用し、RBMS3が関与する細胞内シグナル伝達経路に必須である細胞外マトリックスのリモデリングを阻止する。LY294002とWortmanninは共にPI3K阻害剤であり、PI3K/ACT経路を遮断することによりRBMS3を阻害し、RBMS3の機能的役割に必要な細胞生存と増殖シグナルの減少をもたらす。PD98059はMEKの阻害剤として機能し、MAPK/ERK経路を遮断することにより、RBMS3のRNA結合活性の下流にある転写因子を阻害する。SP600125は、JNK阻害剤として、アポトーシスの制御に関連するJNKシグナル伝達経路を阻害し、RBMS3がそのRNA結合および安定化機能を通じて関与するプロセスを阻害する。
阻害経路を続けると、SB203580はp38 MAPKを特異的に標的とし、RBMS3がRNAプロセシングを通じて制御している可能性のある炎症反応やストレス反応に影響を与える。もう一つのMEK1/2阻害剤であるU0126は、RBMS3の影響を受ける遺伝子発現調節と細胞増殖に重要なMAPK/ERKシグナル伝達経路を阻害する。ラパマイシンは、RBMS3がRNAの結合と調節を通じて関与するタンパク質合成と細胞周期の進行に関与するmTORを阻害する。トリコスタチンAは、ヒストン脱アセチル化酵素を阻害することにより、クロマチン構造と遺伝子発現を変化させ、RNAプロセシングにおけるRBMS3の役割に影響を与える。アピゲニンはプロテインキナーゼCK2を阻害し、RBMS3が関与する経路を含む様々な細胞内経路に影響を与える。ZM447439はオーロラキナーゼを阻害するが、オーロラキナーゼは有糸分裂の進行に重要な役割を果たす。最後に、Y-27632はROCK阻害剤として、細胞の形状、運動性、収縮に影響を及ぼすが、これらはRNA結合活性を通じてRBMS3が制御している可能性のある領域である。
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