PNMA6A活性化剤は、このタンパク質の活性調節に収束する様々なシグナル伝達経路を介して機能する。細胞内のcAMPレベルを上昇させる薬剤は、アデニルシクラーゼを直接刺激するか、Gタンパク質共役型受容体経路を介する。このようなcAMPの上昇は、プロテインキナーゼA(PKA)および他のcAMP応答性エレメントを活性化し、PNMA6Aがそのような翻訳後修飾に感受性があると仮定すると、PNMA6Aのリン酸化とそれに続く活性化につながる可能性がある。同様に、cAMPやcGMPの分解を阻害する化合物は、細胞内でこれらのセカンドメッセンジャーのレベルを上昇させ、シグナル伝達やcAMPまたはcGMP依存性経路の活性状態を延長することにより、PNMA6Aの活性を増強する可能性がある。
さらに、ジアシルグリセロール(DAG)を模倣する活性化因子や、細胞内カルシウム濃度を直接上昇させる活性化因子は、プロテインキナーゼC(PKC)や他のカルシウム依存性タンパク質を活性化し、PNMA6Aがこれらのキナーゼの基質であれば、PNMA6Aをリン酸化して活性化する可能性がある。ストレスシグナルもPNMA6Aの活性化に一役買っている。ある種のタンパク質合成阻害剤は、ストレス活性化プロテインキナーゼ経路を開始させ、それがPNMA6Aのリン酸化と活性化につながるからである。さらに、ポリフェノール化合物は様々な細胞内シグナル伝達経路に影響を及ぼし、それがPNMA6Aの制御機構と交差して、細胞内シグナル伝達カスケードの複雑なネットワークを介してPNMA6Aの活性化につながる可能性がある。
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