PDF阻害剤

一般的な PDF 阻害剤には、Actinonin CAS 13434-13-4、Actinonin CAS 13434-13-4、および GM 6001 CAS 142880-36-2 などがあるが、これらに限定されない。

PDF阻害剤は主にペプチド deformylase（PDF）を標的としており、これは細菌のタンパク質合成に不可欠な酵素です。PDFの阻害は主に酵素の活性部位に結合することで達成され、これにより基質ペプチドとの相互作用が減少します。例えば、天然物由来の阻害剤であるアクチノニンは、PDFの活性部位への結合を中心とした作用機序を持っています。同様に、BB-83698やLBM-415（NVP PDF-713）などの化合物も、アクチノニンの構造を参考に、あるいはそれを改良した構造設計により、この作用機序に従っています。

GM6001は、主にマトリックスメタロプロテアーゼ阻害剤として知られているが、PDFに対しても阻害効果を示しており、一部の化合物は複数の標的に作用しうることを示している。RB-005、BB-3497、GSK1322322など、他のほとんどの化合物は、酵素の活性部位を占めることで機能し、基質ペプチドが酵素にアクセスする方法に影響を与えます。