プロトカドヘリン11 Y結合型(PCDH11Y)は、ヒトではY染色体上にあるPCDH11Y遺伝子によってコードされるタンパク質である。この遺伝子はプロトカドヘリンファミリーの一部であり、カドヘリンスーパーファミリーのサブグループである。カドヘリンは1型膜貫通タンパク質の一種で、機能するためにカルシウムイオンに依存しており、組織内の細胞同士を結合するアドヘレンスジャンクションを形成し、細胞接着に重要な役割を果たしている。
PCDH11Yは神経系の発達に関与していると考えられており、主に脳で発現している。神経回路の複雑な配線と機能に寄与している可能性があり、認知と記憶のプロセスにも関与している。PCDH11Yが属するプロトカドヘリンファミリーは、神経系における細胞の多様性の分子基盤を提供し、神経細胞の特異的な結合経路を促進することに関与していることで知られている。この遺伝子がY染色体上に存在することは、この遺伝子が性特異的な機能や効果を持ち、男性の脳の構造や機能の違いに影響を与えている可能性を示唆している。この遺伝子の進化の歴史は注目に値する。ヒトの系統ではX染色体からY染色体への転座の結果であり、ヒト科の動物には存在するが、他の哺乳類には存在しないからである。PCDH11Yの研究は、男女間の遺伝的差異とヒトの脳の発達に関する洞察を提供することができる。
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