ORP-6の化学的阻害剤には、脂質代謝とシグナル伝達経路の異なる側面を標的とし、この脂質輸送タンパク質の機能的活性に影響を与える様々な化合物が含まれる。GW4869は、中性スフィンゴミエリナーゼを阻害することによってスフィンゴミエリンの加水分解を阻害し、その結果、脂質輸送におけるORP-6の役割にとって重要な要素であるセラミドレベルが低下する。同様に、Rasファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤であるマヌマイシンAは、ORP-6のような脂質輸送タンパク質の制御に不可欠な経路であるRasシグナル伝達を阻害し、脂質輸送活性を低下させる。もう一つのファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤であるティピファルニブは、細胞内シグナル伝達に関与するタンパク質のファルネシル化を阻害する。
シンバスタチンは、HMG-CoA還元酵素を阻害することによって、ORP-6の必須基質であるコレステロール生合成と他のイソプレノイドを低下させ、それによって間接的にコレステロール輸送機能を阻害する。ペルヘキシリンのカルニチンパルミトイルトランスフェラーゼ-1に対する作用は、脂肪酸代謝とミトコンドリア機能を変化させ、ORP-6が関与している脂質の恒常性と輸送活動を混乱させる可能性がある。トリフルオペラジンは、カルモジュリン依存性のプロセスを阻害することによって、ORP-6の脂質シグナル伝達経路における活性に重要な細胞内カルシウムレベルを変化させることができる。脂肪酸合成酵素阻害剤であるセルレニンは、脂肪酸合成を減少させ、基質の利用可能性を制限することにより、ORP-6の脂質伝達機能に影響を与えることができる。プロゲステロンは、脂質転移タンパク質と結合し、その脂質結合と転移特性を変化させることにより、ORP-6の機能を阻害することができる。ゴシポールは多酵素阻害剤として、ORP-6の脂質との相互作用を損ない、その脂質転移能力を効果的に阻害することができる。フィリピンのコレステロールに対する強い親和性は、コレステロールを隔離することによってORP-6を阻害し、ORP-6によるコレステロールの移動を妨げることができる。PD 98059はMEKを標的とし、ORP-6が脂質代謝あるいは脂質転移活性のために依存していると思われる経路であるERKシグナル伝達を阻害する。最後に、LY294002はPI3Kを阻害し、PIP3レベルを低下させる。これは、PI3K活性に依存する脂質シグナル伝達あるいは輸送におけるORP-6の役割を阻害する可能性がある。これらの阻害剤は、それぞれ異なるメカニズムで、ORP-6の阻害に収束し、細胞内での脂質の輸送と制御の能力に影響を与える。
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