NXF2の化学的阻害剤は様々なメカニズムで阻害効果を発揮し、それぞれがRNA輸出におけるタンパク質の機能の異なる側面を標的としている。レプトマイシンBとラジャドンは、NXF2を含むタンパク質の核外輸送に必須であるエキスポーティン1(CRM1)経路に作用する。CRM1を阻害することにより、これらの化合物はNXF2の核内保持をもたらし、核から細胞質へのRNAの輸出を促進するNXF2の能力を阻害する。このようにCRM1経路を特異的に阻害することで、NXF2がmRNAの輸送プロセスで役割を果たせなくなり、その機能が効果的に阻害される。同様に、ビスフェノールAのような化合物は核内受容体シグナル伝達を阻害し、核内受容体がNXF2を含むRNA輸送機構の制御に不可欠な役割を果たしているため、NXF2の機能に下流から影響を及ぼす可能性がある。
さらに、NXF2が適切に機能することは、細胞の転写装置や微小管ネットワークの動態と密接に結びついている。トポイソメラーゼI阻害剤であるカンプトテシンやトポイソメラーゼII阻害剤であるエトポシドは、転写中にトポロジカルストレスを発生させ、NXF2とmRNA輸送機構との結合を破壊する可能性がある。この混乱は、NXF2がmRNAに結合し、その輸送を助ける能力を阻害する可能性がある。α-アマニチンとアクチノマイシンDは、それぞれRNAポリメラーゼIIとDNAを標的とし、mRNAの合成を減少させる。産生されるmRNA分子が少なくなると、NXF2は相互作用して輸送する基質が少なくなり、本来の機能が阻害される。さらに、パクリタキセル、ノコダゾール、コルヒチン、ビンブラスチン、ビンクリスチンのような化学物質は微小管ネットワークを破壊し、NXF2がmRNAの効率的な輸送に依存していると思われる微小管依存性のプロセスを阻害する可能性がある。微小管を不安定化することにより、これらの化合物はNXF2がmRNAの輸送を促進するのに必要な細胞基盤を破壊し、mRNAの輸送におけるNXF2の役割を機能的に阻害することにつながる可能性がある。
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