MRP-L18の化学的阻害剤は、MRP-L18が局在し、タンパク質合成に重要な役割を果たすミトコンドリアのリボソームを直接標的とすることで機能する。クロラムフェニコールは、ミトコンドリアのリボソームのペプチジルトランスフェラーゼ成分に結合することによってこの阻害を達成し、新しいタンパク質の合成に不可欠なステップであるペプチド結合形成を阻害する。この作用はMRP-L18の機能を直接阻害し、ミトコンドリア内でのタンパク質の組み立てに貢献できなくなる。同様に、リネゾリドはミトコンドリアのリボソームに結合し、タンパク質合成の開始に必要な開始複合体の形成を妨げ、リボソーム構造に対するMRP-L18の機能的寄与を直接阻害する。テトラサイクリンとドキシサイクリンは、共にミトコンドリアリボソームの30Sサブユニットに結合し、アミノアシルtRNAのリボソームアクセプター部位への結合を阻害する。これは、タンパク質の伸長の前提条件であり、従って、タンパク質の組み立てにおけるMRP-L18の役割には必須である。
ミノサイクリンとチゲサイクリンは、同様のメカニズムでMRP-L18に阻害効果を発揮する。ミトコンドリアのリボソームに結合すると、タンパク質合成プロセスが阻害され、MRP-L18はリボソーム操作の機能を果たせなくなる。リボソームサブユニットの反対側では、エリスロマイシン、アジスロマイシン、クラリスロマイシン、テリスロマイシンが50Sサブユニットに不可逆的に結合し、新生ペプチド鎖の出口トンネルをブロックし、リボソーム機構の一部としてのMRP-L18の適切な機能を妨げる作用がある。ロキシスロマイシンも50Sサブユニットを標的とし、ミトコンドリアタンパク質の合成を阻害し、結果としてMRP-L18の役割を阻害する。最後に、フシジン酸はミトコンドリア内の伸長因子Gの働きを阻害し、タンパク質合成の転位ステップに重要な役割を果たす。
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