一般にH2AFYと呼ばれるMACROH2A1は、クロマチン構成の複雑さにおいて重要な役割を果たしている。H2AFYの活性化因子は主に、クロマチンダイナミクスの様々な側面を調節することによって機能し、MACROH2A1の関与と機能に直接的または間接的に影響を与える。トリコスタチンA(TSA)やボリノスタットのようなヒストン脱アセチル化酵素阻害剤は、ヒストンからアセチル基を除去する酵素を特異的に標的とする。DNAメチル化を標的とする5-アザシチジンは、BIX-01294、Chaetocin、UNC1999などの異なるヒストンメチルトランスフェラーゼを阻害する他の化合物とともに、クロマチン状態の決定因子であるヒストンメチル化の景観に寄与している。これらの分子は、ブロモドメイン阻害剤PFI-1のような、クロマチン修飾の異なる側面を標的とする他の分子とともに、化学化合物がクロマチン環境に影響を与え得る方法の多様性を示しており、その結果、MACROH2A1の役割と機能に影響を与えている。
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