PD 0332991塩酸塩とU0126は、それぞれ細胞周期を停止させたり、増殖シグナル伝達経路を遮断したりする化合物の一例である。CDK4/6酵素とMEK酵素を阻害することで、細胞周期と細胞分化の進行を変化させ、これらの過程に関与するタンパク質に影響を与える可能性がある。LY294002とGSK2126458はPI3K/ACT/mTOR経路の阻害剤であり、この経路は細胞の生存、成長、代謝に重要なシグナル伝達軸である。この経路の阻害は、タンパク質の機能と発現に大きな変化をもたらし、LOC729729の機能に影響を与える可能性がある。
SP600125、SB203580、PD98059などの化合物は、炎症や環境ストレスに対する細胞応答に関与するJNKやp38 MAPKなどのストレス活性化プロテインキナーゼを標的としている。これらのキナーゼを阻害することで、これらのシグナル伝達カスケードの一部であるタンパク質の機能を変化させることができる。幅広いチロシンキナーゼ阻害剤であるダサチニブは、複数のキナーゼを阻害することができるため、さまざまなシグナル伝達経路を変化させ、それらの経路に関与するタンパク質に影響を与える可能性がある。ボルテゾミブとラパマイシンは、それぞれタンパク質のターンオーバーと合成を標的とする阻害剤の一例である。ボルテゾミブによるプロテアソームの阻害は、タンパク質の蓄積と分解の変化を引き起こす可能性があり、ラパマイシンによるmTORの阻害は、タンパク質合成とオートファジーに影響を与え、これらのプロセスによって制御されるタンパク質に影響を与える可能性がある。最後に、ABT-199とNutlin-3はアポトーシスと細胞生存に関与するタンパク質を標的としている。ABT-199のBcl-2阻害はアポトーシス経路を誘導し、Bcl-2ファミリーと相互作用するタンパク質に影響を与える可能性がある。
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