LY294002はPI3Kを阻害し、それによってAKTのリン酸化を低下させ、生存と増殖に関連するタンパク質の機能に影響を与える可能性のある下流のシグナル伝達に影響を与える。PD98059とU0126はともにMEK阻害剤であるが、U0126の方がMEK1/2に対する選択性が高く、両化合物ともMAPK/ERK経路を破壊し、細胞の増殖と分化に関与するタンパク質の活性を変化させる可能性がある。SB203580とSP600125は、MAPキナーゼファミリーの異なるメンバー、すなわちそれぞれp38 MAPKとJNKを標的とする。これらのキナーゼはストレス、炎症、アポトーシスシグナルに対する反応に関与しており、それらの阻害は関連タンパク質の機能に影響を与える可能性がある。PP2はSrcファミリーチロシンキナーゼを阻害し、細胞接着や成長などのプロセスを支配する様々なシグナル伝達経路に影響を与える。一方、Y-27632はRho関連キナーゼROCKを阻害し、細胞骨格ダイナミクスや細胞運動に関連するタンパク質に影響を与える可能性がある。
MG132はプロテアソーム阻害剤として作用し、分解を阻害することで細胞内のタンパク質量を増加させ、多くの細胞プロセスに影響を与える可能性がある。LY83583はグアニル酸シクラーゼを阻害し、cGMP依存性の経路に影響を与え、タンパク質の機能に影響を与える。一方、DAPTはγセクレターゼを阻害し、細胞の分化に関与するNotch経路のシグナル伝達に変化を与える可能性がある。BAPTA-AMはカルシウムキレーターとして機能し、様々な細胞機能に重要なカルシウムシグナル伝達を阻害し、これらのシグナルによって制御されるタンパク質に影響を与える可能性がある。最後に、KN-93はCaMKII阻害剤であり、カルシウム/カルモジュリン依存性シグナル伝達経路を調節し、シナプス可塑性に関連するタンパク質に影響を与える可能性がある。
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