LY294002とU0126は、それぞれPI3K/Akt経路とMAPK/ERK経路を標的とし、細胞増殖と生存の制御に極めて重要である。PI3Kを阻害することにより、LY294002はその後のAktシグナル伝達を阻害し、この経路の下流のタンパク質の制御を変化させる。同様に、U0126はMEK1/2キナーゼを阻害することで、MAPK/ERKシグナル伝達を停止させ、この経路に関連するタンパク質に影響を与える。ラパマイシンは、細胞増殖制御の中心的な担い手であるmTOR複合体に結合するため、mTORシグナル伝達ネットワークの一部であるタンパク質に影響を与えることができる。PP2は、Srcファミリーキナーゼを阻害することにより、細胞接着と血管新生を調節し、それによってこれらの経路に絡むタンパク質に影響を与える。
Nutlin-3は、MDM2-p53相互作用を阻害することにより、細胞ストレス応答における役割で知られるp53経路によって制御される多数のタンパク質に影響を与える。SP600125はJNK活性を停止させ、ストレス応答に関連するタンパク質の機能を変化させる可能性がある。SB431542はTGF-β受容体を阻害し、TGF-βシグナル伝達経路を変化させ、この経路に関与するタンパク質の役割に影響を与える。ZM-447439はオーロラキナーゼを阻害することにより細胞分裂を阻害し、有糸分裂の進行に重要なタンパク質に影響を与える。さらに、レフルノミドはジヒドロオロチン酸デヒドロゲナーゼを阻害することによりピリミジン生合成を阻害し、ヌクレオチドに依存するタンパク質の合成や機能に影響を与える可能性がある。チロシンキナーゼ阻害剤であるイマチニブは、細胞増殖シグナル伝達を調整し、関連タンパク質に影響を与える。PARP阻害剤であるオラパリブは、DNA損傷応答に関与するタンパク質に影響を与える。ボルテゾミブは、プロテアソームを阻害することにより、細胞周期制御やシグナル伝達において重要なタンパク質の分解に影響を与え、それによってこれらの経路におけるタンパク質の安定性や機能に影響を与える可能性がある。
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