WortmanninとAlsterpaulloneは、それぞれPI3Kとサイクリン依存性キナーゼを阻害することにより、シグナル伝達カスケードと細胞周期の進行に変化をもたらす。U0126とSP600125は、MEKとJNKを標的として阻害し、MAPK/ERK経路とストレス応答経路を調節し、これらのシグナル伝達ネットワークの一部であるタンパク質に影響を与える。
プロテインキナーゼCやHsp90と相互作用したり、それによって制御されているタンパク質は、シグナル伝達カスケードやタンパク質のフォールディング経路を不安定化させるGö6976やゲルダナマイシンの影響を受ける可能性がある。PD173074とBML-275は、FGFRとAMPK経路を標的とし、ひいてはこれらの成長・代謝シグナルを中継するタンパク質に影響を与えるという、より焦点を絞ったアプローチを提供する。SB431542とY-27632は、TGF-β受容体活性とROCK依存性細胞骨格ダイナミクスを調節する役割を持ち、これらのプロセスに関連するタンパク質に影響を与える可能性がある。最後に、MG-132とラパマイシンは、それぞれプロテアソーム活性とmTORを阻害することで、細胞内のタンパク質の蓄積とタンパク質合成の減少を引き起こし、LOC400553に間接的に関連するタンパク質を含む、広範なタンパク質の安定性と産生に影響を及ぼす可能性がある。
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