IQGAP3活性化因子は均質な化合物群ではなく、細胞骨格動態や細胞増殖におけるIQGAP3の制御的役割に間接的に影響を与えうる多様な化学物質の配列である。これらの化合物は、IQGAP3の機能と交差する様々なシグナル伝達経路や細胞プロセスに作用する。例えば、PMAはDAGを模倣することにより、PKC経路を通して間接的にIQGAP3に影響を与え、アクチン組織に影響を与える可能性がある。対照的に、カルペプチンのカルパイン阻害は、IQGAP3と同じ経路で重要な細胞タンパク質を安定化させ、間接的にその安定性と機能を高めるかもしれない。
U73122やGö 6983のような他の化学物質は、それぞれホスホリパーゼCやPKC活性を調節するが、これらはIQGAP3が関与するシグナル伝達経路の上流にあるか、並行している。これは、IQGAP3が関与する細胞骨格組織や細胞増殖に変化をもたらす可能性がある。jasplakinolideやblebbistatinのような化合物は、アクチン動態やミオシンII活性に影響を及ぼし、それによってIQGAP3によって制御される細胞機能に影響を及ぼす可能性がある。同様に、ROCK、MLCK、Arp2/3複合体の阻害剤、例えばそれぞれY-27632、ML-7、CK-666は、間接的にアクチン細胞骨格に影響を与え、IQGAP3活性を調節する可能性がある。フォルスコリンによるcAMPレベルの上昇、塩化リチウムによるGSK-3βの阻害、SB 203580によるp38 MAPKの標的化、LY294002によるPI3K阻害は、IQGAP3の活性が間接的に調節される可能性のある多様なメカニズムを示しており、細胞内シグナル伝達の複雑さとタンパク質制御の統合的性質を反映している。
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