Hrs-2の化学的阻害剤は、エンドサイトーシス輸送とエンドソーム機能におけるタンパク質の役割の様々な側面をターゲットにしている。イソチオシアン酸ベンジルは、システイン残基を共有結合で修飾することによってHrs-2を阻害することができる。同様に、クロロキンのようなエンドソームのpHを変化させる薬剤は、エンドサイトーシスされた物質を選別するHrs-2の活性にとって重要な酸性環境を損なう。イオノフォアであるモネンシンはエンドソームのイオン勾配を破壊し、エンドソーム内での正しい荷物の輸送を促進するHrs-2の能力をさらに阻害する。バフィロマイシンA1もまた、V-ATPaseプロトンポンプを阻害することによって酸性化プロセスを標的とし、Hrs-2に依存する分子のエンドソームでの選別を妨げる可能性がある。
ダイナソアのような他の阻害剤は、ダイナミンを標的とすることでエンドサイトーシスのプロセスそのものを阻害する。ダイナミンは細胞膜からの小胞の脱離に必須であり、Hrs-2のその後のエンドソーム機能を間接的に阻害する可能性がある。同様に、ピットストップ2はクラスリンを介するエンドサイトーシスを阻害するが、この経路はHrs-2のエンドソーム選別の役割につながる。イトラコナゾールやメチル-β-シクロデキストリンのようなエンドソームのコレステロール恒常性を乱す化合物も、エンドソーム膜の脂質組成を変化させ、Hrs-2の機能にとって重要な脂質ラフトを乱す可能性があることによって、Hrs-2を阻害することができる。フィリピンIIIはコレステロールに結合し、Hrs-2が働く膜ドメインを乱す可能性がある。チロシンキナーゼ阻害剤であるゲニステインは、Hrs-2が介在するシグナル伝達や輸送相互作用に必要と思われるリン酸化を阻害することができる。それぞれ微小管とアクチンフィラメントを阻害するノコダゾールやサイトカラシンDのような阻害剤は、細胞内でのエンドソームの適切な位置決めと移動を妨げることによってHrs-2を阻害し、それによってエンドソームの選別プロセスにおけるタンパク質の役割を阻害することができる。
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