HOMEZの阻害剤は様々な生化学的メカニズムで作用し、それぞれが、タンパク質の活性に重要な特定のシグナル伝達経路を破壊するように調整されている。例えば、いくつかの化合物は、HOMEZの機能を制御するリン酸化過程に不可欠な細胞内のキナーゼ活性を標的とすることで阻害効果を発揮する。これらのリン酸化過程が阻害されると、HOMEZの活性が低下する。他の分子は、PI3K経路のようなシグナル伝達カスケードに特異的に拮抗する。PI3K経路は、HOMEZを安定化させたり活性化させたりするものも含め、様々な細胞調節メカニズムに関与している。この経路を阻害することにより、これらの阻害剤はHOMEZを不安定化し、その活性を減弱させることができる。さらに、タンパク質合成と細胞増殖に関与することで知られるmTOR経路を阻害すると、HOMEZの活性が低下することから、HOMEZの機能はmTORを介したシグナル伝達に依存している可能性が示唆される。
さらに、ヘッジホッグシグナル伝達経路やERK/MAPKシグナル伝達を阻害する化合物は、HOMEZと相互作用したり、HOMEZを制御する転写因子やコアクチベーターを調節することによって、HOMEZを間接的に抑制する可能性がある。阻害のもう一つの側面として、p38 MAPKを介するようなストレス応答経路の破壊があり、これはHOMEZの制御機構と交差する可能性がある。プロテアソーム阻害剤は、細胞ストレスを誘導し、細胞内の分解環境に影響を与え、HOMEZ活性を低下させることにより、異なる阻害様式を導入する。低酸素シグナル伝達や転写装置のクロマチン認識機構を破壊する阻害剤もまた、転写環境を変化させるか、HOMEZに必須な共制御タンパク質の分解を促進することにより、間接的にHOMEZを抑制する。
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