Elongin A3活性化剤は、転写機構とクロマチン構造に影響を与え、それによって転写伸長因子の活性を調節する化合物である。トリコスタチンAとボリノスタットは、ヒストンのアセチル化を増加させることによってクロマチンを弛緩させ、RNAポリメラーゼIIとその関連因子(エロンギンA3を含む)の進行を促進することができる。これらの化合物によって誘導される変化したクロマチン状態は、遺伝子の転写能力を増強し、その結果、転写需要の増大に対応するために伸長因子の機能が必要となり、促進される可能性がある。
さらに、5-アザシチジンやミトラマイシンAのような化合物は、それぞれDNAメチル化とDNA結合に影響を与えるが、転写の状況を変化させるので、転写機構はエロンギンA3のような因子からのさらなるサポートを必要とするかもしれない。S-アデノシルメチオニンやアナカルジン酸のようなエピジェネティックな状態の修飾因子は、エピジェネティックなマークに対するメチル基の利用可能性を変化させることにより、転写機構に間接的に影響を与え、転写伸長に影響を与える可能性がある。転写プロファイルを調節するβ-エストラジオールのようなホルモンも、転写伸長因子の必要性に影響を与える可能性がある。一方、MG-132は転写関連因子の分解を防ぐことができ、核内におけるElongin A3の存在を増加させる可能性がある。
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