CMTM6活性化剤には、多様なシグナル伝達経路や細胞プロセスを通じてCMTM6の機能的活性化を引き起こすことができる様々な化合物が含まれる。フォルスコリンとジブチリル-cAMPは、細胞内のサイクリックAMP(cAMP)レベルを上昇させ、その後プロテインキナーゼA(PKA)を活性化する薬剤である。PKAは様々なタンパク質をリン酸化することが知られており、そのうちのいくつかはCMTM6と直接相互作用し、その機能的活性を高める可能性がある。同様に、IBMXはcAMPの分解を阻害し、間接的にPKAの持続的な活性化と、PKAを介したリン酸化プロセスによるCMTM6の活性化を促進する。
別の面では、PMAやイオノマイシンのような化合物は、それぞれプロテインキナーゼC(PKC)を活性化し、細胞内カルシウムレベルを上昇させる。PKCとカルシウム依存性キナーゼは、CMTM6の活性を直接調節するものも含め、数多くの細胞内タンパク質のリン酸化に関与している。プロテインホスファターゼの阻害剤であるカリンクリンAとオカダ酸は、タンパク質をリン酸化状態に維持し、その結果、CMTM6の活性が増強される。エピガロカテキンガレート(EGCG)は、キナーゼとホスファターゼに対してより一般的な作用を示し、リン酸化の様相を変化させ、CMTM6を活性化させる。アニソマイシンとスタウロスポリンは、それぞれ主にタンパク質合成とキナーゼの阻害に関連するが、ストレス活性化プロテインキナーゼを活性化することもでき、これは間接的にCMTM6の活性を高めるリン酸化現象につながる可能性がある。U0126は、MEK1/2を阻害することで、CMTM6と相互作用し、CMTM6を活性化するタンパク質の制御に収束する細胞内シグナル伝達ネットワークの代償機構を誘導する可能性がある。
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