ホスホイノシチド3-キナーゼ(PI3K)経路では、WortmanninやLY294002のような阻害剤が、C9orf71が支配している可能性のあるものを含む多くの細胞応答にとって極めて重要なシグナル伝達カスケードを停止させることによって影響力を発揮する。同様に、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MAPK)の領域は、MEK阻害剤として機能するPD98059やU0126のような化合物によって標的とされ、MAPK/ERK経路を阻害する。哺乳類ラパマイシン標的(mTOR)は、細胞の成長と増殖におけるもう一つの重要なプレーヤーであり、その阻害剤であるラパマイシンは、このような細胞活動を変化させ、C9orf71の影響範囲と交差する可能性がある。並行して、SB431542によって阻害されたTGF-β受容体キナーゼは、C9orf71が関与している可能性のある様々な細胞プロセスに影響を与え、細胞の分化と恒常性に影響を与える可能性がある。
ストレス応答とアポトーシス経路を修正するJNK阻害剤であるSP600125とROCK阻害剤であるY-27632は、細胞骨格の動態に影響を与え、結果としてC9orf71に関連するメカニズムに影響を与える可能性がある。細胞内カルシウムレベルを乱すタプシガルギンはSERCAポンプに作用し、C9orf71のシグナル伝達環境に影響を与える。2-デオキシ-D-グルコースによって解糖が阻害され、C9orf71が活動する代謝環境が変化する可能性がある。同様に、ゴルジ装置機能に対するブレフェルジンAの作用は、タンパク質の輸送と局在に変化をもたらし、C9orf71の細胞内での役割に影響を与える可能性がある。汎カスパーゼ阻害剤であるZ-VAD-FMKによるアポトーシス機構の阻害は、C9orf71の活性を調節するもう一つの道を提供する。
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