フォルスコリンは、細胞内のcAMPレベルを上昇させ、それによってプロテインキナーゼA(PKA)を活性化し、CREBなどの転写因子の活性に影響を与えることによって、C9orf16などの遺伝子の転写を高める可能性があることが認められている。同様に、IBMXはホスホジエステラーゼを阻害することによってcAMPレベルを維持し、PKAの活性化を強化して遺伝子発現への影響を拡大する。並行して、PMAやイオノマイシンのような化合物は、異なる経路で作用する。PMAはプロテインキナーゼC(PKC)を活性化し、このPKCが一連の転写因子をリン酸化し、C9orf16の発現を変化させる可能性がある。イオノマイシンは、細胞内カルシウム濃度を上昇させることにより、遺伝子転写に影響を与える可能性のあるカルシウム依存性のシグナル伝達カスケードを引き起こす。5-アザシチジンとトリコスタチンAの作用はエピジェネティクスの領域に踏み込んでおり、前者はDNAの脱メチル化につながるDNAメチルトランスフェラーゼを阻害し、後者はヒストン脱アセチル化酵素を阻害する。
レチノイン酸は核内受容体に関与し、遺伝子発現プロファイルを再プログラムすることができ、それによってC9orf16を含む多くのタンパク質のレベルに影響を与える。(-)-エピガロカテキンガレートは、様々なシグナル伝達分子や経路を調節することができる。もう一つのヒストン脱アセチル化酵素阻害剤である酪酸ナトリウムは、ヒストンのアセチル化を促進し、遺伝子の発現を促進する転写寛容状態にさらに寄与する。PI3K阻害剤LY294002、MEK阻害剤PD98059、JNK阻害剤SP600125は、それぞれ重要なシグナル伝達経路内の異なるキナーゼを標的とする。PI3K/ACT、MEK/ERK、JNK経路を調節することにより、これらの阻害剤は間接的に転写調節メカニズムに影響を与え、C9orf16の発現パターンに変化をもたらす可能性がある。
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