フォルスコリンとIBMXは細胞内のcAMPを上昇させ、それによってPKAや他のcAMP依存性タンパク質を活性化し、C9orf135を含む遺伝子発現を制御することができる。PMAは、PKCを活性化することにより、転写因子の下流に作用し、細胞の転写環境に影響を与える。イオノマイシンは、細胞内カルシウムレベルを上昇させる能力により、カルシウム依存性タンパク質や経路を活性化し、遺伝子発現に影響を与える可能性がある。
この化学物質クラスには、5-アザシチジンやトリコスタチンAのようなエピジェネティック修飾剤も含まれ、これらはDNAやヒストンの修飾を変化させ、C9orf135をアップレギュレートしうる転写寛容状態に導く。レチノイン酸は、核内受容体に結合することにより、C9orf135を含む遺伝子発現に広範な影響を及ぼす。ポリフェノール化合物(-)-エピガロカテキンガレートとヒストン脱アセチル化酵素阻害剤酪酸ナトリウムは、ともに細胞内シグナル伝達とクロマチンアクセシビリティに影響を及ぼし、C9orf135の発現を増加させる可能性がある。PI3Kに対するLY294002、MEKに対するPD98059、JNKに対するSP600125といった主要なシグナル伝達キナーゼの阻害剤もこのクラスに属する。それぞれの経路を調節することにより、これらの阻害剤は細胞のシグナル伝達の状況を変化させ、転写因子の活性や遺伝子発現に影響を与える可能性がある。
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