C12orf45阻害剤は、C12orf45タンパク質の活性や発現を調節するようにデザインされた化合物のコレクションである。直接的な阻害剤に関する情報は限られているが、このタンパク質に関連する潜在的なシグナル伝達経路に影響を与える、より広範な間接的阻害剤に焦点が移っている。PI3Kは、多くの細胞内プロセスにおいて極めて重要な酵素であり、WortmanninやLY294002のような阻害剤の標的となりうる。一方、細胞シグナル伝達において重要なMAPK経路には、U0126やPD98059によって阻害されうる成分がある。
さらに、細胞ストレスとアポトーシスに関与するJNK経路は、SP600125を用いて標的とすることができる。炎症反応と細胞ストレスに関連するp38 MAPK経路は、SB203580を用いて影響を及ぼすことができる。一方、C12orf45が関与している可能性のある細胞周期過程は、ZM-447439のようなオーロラキナーゼ阻害剤やOlomoucine IIのようなCDK阻害剤によって影響を受ける。最後に、Go 6983、ラパマイシン、DAPTは、C12orf45の機能と交わる可能性のある様々な経路を幅広く阻害する。
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