C12orf11の化学的阻害剤は、C12orf11が関与する特定のシグナル伝達経路、特に細胞成長、増殖、生存を含む多くの細胞プロセスに不可欠なPI3K/AKT経路を阻害することにより、阻害効果を発揮することができる。WortmanninとLY294002はどちらもホスホイノシチド3キナーゼ(PI3K)の阻害剤であり、C12orf11が関連するAKTリン酸化の減少をもたらす。PI3K/AKT経路を障害することによって、これらの阻害剤はC12orf11の細胞内での役割に重要であると思われるシグナル伝達を混乱させることができる。同様に、mTOR阻害剤であるラパマイシンも同じ経路で作用し、mTORを阻害することで、C12orf11に関連するものを含む可能性のあるタンパク質合成やその他の細胞機能が低下する。
前述の阻害剤に加えて、TriciribineとGSK690693はAKTのリン酸化を特異的に標的とし、MK-2206はAKTのアロステリック阻害剤として機能する。ペリホシンは、AKTを阻害することにより、C12orf11が関与する可能性のあるシグナル伝達カスケードであるPI3K/ACT経路を破壊する。TOR/PI3K阻害剤であるPalomid529、強力なAKT阻害剤であるAZD5363、同じくPI3K/ACT経路を標的とするMiltefosineは、それぞれこの経路を介したシグナル伝達を減少させ、C12orf11が関与する機能を阻害する。ZSTK474とPF-04691502は、そのPI3K阻害活性により、C12orf11の細胞内役割に必要なPI3K/AKT経路の阻害をさらに強化する。総合すると、これらの阻害剤は、C12orf11の機能的活性によって制御される、あるいはC12orf11の機能的活性に依存する細胞および生化学的プロセスを阻害することができる。
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