血液B群抗原阻害剤には、この抗原の合成に関与する生化学的経路を抑制または調節する可能性のある化合物が含まれる。これには、ツニカマイシンやスワインソニンのようなグリコシル化阻害剤、カスタノスペルミンやデオキシノジリマイシンのようなグルコシダーゼ阻害剤、キフネンシンのようなマンノシダーゼ阻害剤が含まれ、これらは糖タンパク質のプロセッシングや成熟に影響を及ぼす可能性がある。
ベンジル2-アセトアミド-2-デオキシ-α-D-ガラクトピラノシドのような化合物は、合成酵素α-1,3-ガラクトシルトランスフェラーゼの特異的阻害剤であり、血液型B群抗原の合成を担う酵素活性を直接標的とする。解糖を阻害する2-デオキシ-D-グルコースや、金属依存性酵素に影響を与える塩化マンガンも、グリコシル化過程に影響を与える可能性がある。ブレフェルジンA、モネンシン、リトナビルのようなタンパク質の輸送とプロセシングを阻害する物質は糖タンパク質の合成経路に影響を与える可能性がある。PDMPはスフィンゴ糖脂質の合成を阻害することにより、関連するグリコシル化経路に影響を与える可能性がある。
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