フォルスコリンは、細胞内のcAMPレベルを上昇させる能力で知られており、その結果PKAが活性化され、細胞内のリン酸化状態が亢進し、β3Gn-T9の活性を促進する可能性がある。エピガロカテキンガレート(EGCG)とゲニステインは、多種多様な経路を通じて効果をもたらす。EGCGがシグナル伝達分子と経路に広範な影響を及ぼすのに対して、ゲニステインはチロシンキナーゼを特異的に阻害し、どちらもβ3Gn-T9の機能を促進しうる細胞状態に至る。同様に、LY294002、ラパマイシン、SB203580、PD98059、SP600125のような低分子阻害剤は、重要なキナーゼや調節タンパク質を標的とし、シグナル伝達ネットワーク内でドミノ効果を効果的に生じさせ、β3Gn-T9の生物学的活性を高める。
イオノマイシンは、多数のシグナル伝達カスケードにおける重要な二次メッセンジャーである細胞内カルシウムを上昇させ、カルシウム依存性タンパク質を活性化し、おそらくβ3Gn-T9活性の上昇をもたらす。対照的に、酪酸ナトリウムと5-アザシチジンは、エピジェネティックな状況を変化させることで影響を及ぼす。酪酸ナトリウムはヒストン脱アセチル化酵素を阻害し、5-アザシチジンはDNAメチル化を阻害する。これらの修飾は、より転写活性の高いクロマチン状態をもたらし、β3Gn-T9遺伝子の発現を増加させる可能性がある。cAMPの合成アナログであるジブチリル-cAMP(db-cAMP)は、内因性cAMPの作用を模倣してPKAを活性化し、β3Gn-T9の活性を支持する細胞環境を促進することができる。
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