AUNIP阻害剤は、AUNIPが本来関与している様々な細胞内プロセスや経路、特に細胞周期調節や中心体凝集に関連する経路を不安定化したり変化させたりすることで影響を及ぼす化学化合物の一群である。例えば、キナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンとロスコビチンは、AUNIPが関与する細胞経路内のタンパク質のリン酸化レベルを低下させ、それによって間接的にAUNIPの機能的活性を低下させる。同様に、タプシガルギンは細胞質カルシウムレベルを上昇させ、AUNIPの機能に影響を及ぼす可能性のあるカルシウム依存性調節機構を混乱させる可能性がある。PD 0332991やパルバラノールBのようなCDK阻害剤もまた、細胞周期の進行を停止させることで役割を果たしており、これはセントロソームの凝集と機能におけるAUNIPの制御的役割と密接に関連している。
その他の阻害剤としては、ZM-447439やArisertibがあり、これらはオーロラキナーゼを特異的に標的とし、染色体の整列と分離に影響を与える。さらに、BI6727、S-トリチル-L-システイン、モナストロールのような阻害剤は、Plk1や有糸分裂キネシンEg5のようなタンパク質を標的とすることによって、有糸分裂の進行と紡錘体の組み立てを阻害し、それによって間接的に有糸分裂紡錘体の組み立てに関連するAUNIPの機能に影響を与える。ミトキサントロンとノコダゾールは、それぞれトポイソメラーゼIIと微小管ダイナミクスを阻害することで、細胞周期におけるAUNIPの適切な機能に不可欠なDNA複製と細胞分裂プロセスに影響を与え、AUNIPの間接的阻害に寄与している。これらの阻害剤を総合すると、AUNIPが関与する経路の複雑なネットワークが示され、これらの多様なメカニズムを通して、AUNIPの発現や活性を直接変化させることなく、AUNIPの機能的活性を低下させる。
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