AP-4ε阻害剤には、AP-4εがその一部であるAP-4複合体の機能に関連する細胞内プロセスやシグナル伝達経路に影響を与える化合物が含まれる。これらの化学物質は、AP-4εが重要な役割を果たしている細胞内輸送と小胞輸送の操作に影響を与えることができる様々なメカニズムを通してその効果を発揮する。AP-4複合体はエンドソームとリソソームへのタンパク質の選別に関与しており、これらのプロセスを制御する経路に障害が生じると、AP-4εの機能に影響を及ぼす可能性がある。
表に挙げた化学物質は、ゴルジ装置動態、微小管の安定性、アクチン細胞骨格の完全性、小胞の分裂、モータータンパク質の活性、Rho GTPaseシグナル伝達、ホスホイノシチド代謝、キナーゼ活性など、細胞機能の様々な側面に影響を与える。これらの側面はそれぞれ、AP-4εが適切に機能するための基本的なプロセスである小胞輸送と膜構成に関与している。ゴルジの構造と機能を変化させることによって、ブレフェルジンAとモネンシンは、AP-4εを介する輸送の重要なステップである小胞の形成と輸送に影響を与えることができる。細胞骨格の完全性と動態は小胞移動に不可欠であり、ノコダゾール、パクリタキセル、サイトカラシンD、ラトルンクリンA、ブレッビスタチンなどの化学物質はこれらの因子に影響を与え、AP-4εの機能に影響を与える可能性がある。ダイナソアのダイナミン阻害はエンドサイトーシス輸送に影響を与え、ML-141のCdc42阻害は細胞骨格構成と小胞輸送に影響を与える。WortmanninのPI3K阻害は、膜輸送に重要なシグナル伝達経路を変化させる可能性がある。
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