例えば、フォルスコリンとIBMXは、多くのシグナル伝達経路におけるセカンドメッセンジャーであり、多数のタンパク質の活性化につながる細胞内cAMPレベルを上昇させる。PMAとイオノマイシンは、それぞれプロテインキナーゼCを活性化する役割と細胞内カルシウムを増加させる役割で知られており、どちらもタンパク質活性の調節に重要であるため、AMAC1の機能を高める可能性がある。EGFはそのレセプターを刺激し、多数のタンパク質に影響を及ぼす可能性のあるシグナル伝達カスケードを開始するが、オルソバナジン酸ナトリウムはタンパク質のリン酸化状態を維持することによって作用する。
塩化リチウムによるGSK-3の阻害は、Wntシグナル伝達経路内のタンパク質の安定化と蓄積を可能にするかもしれない。もう一つのカルシウムイオノフォアであるA23187の使用は、細胞内シグナル伝達におけるカルシウムの重要性と、タンパク質活性を調節する可能性を強調している。ジブチリルアデノシン環状リン酸カルシウムはcAMPの膜透過性アナログとして機能し、cAMP依存性経路を直接刺激し、一方オカダ酸はリン酸化酵素を阻害することによりタンパク質をリン酸化状態に維持する。KN-93は、無数の細胞タンパク質をリン酸化するキナーゼであるCaMキナーゼIIの阻害を介したタンパク質活性の調節に関する洞察を提供する。ゲニステインは、チロシンキナーゼ依存性のシグナル伝達経路を調節することによって、タンパク質の活性に影響を与える方法を提供する。
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