A030009H04Rik活性化剤は、A030009H04Rik遺伝子の発現をアップレギュレートできる化合物であることが特徴である。このような活性化因子の同定は、通常、ハイスループットスクリーニング(HTS)技術を用いた広範なスクリーニングプロセスから始まる。このプロセスでは、発光タンパク質や蛍光タンパク質などの検出可能なレポーターをA030009H04Rik遺伝子プロモーターの制御下に置くレポーター遺伝子アッセイを用いる。このレポーター構築物を組み込んだ細胞を化学化合物のライブラリーに暴露すると、プロモーターを活性化できるものがレポーター遺伝子の発現増加を引き起こし、その結果、測定可能なシグナルが増幅される。このシグナルの大きさはプロモーター活性と直接相関しており、A030009H04Rik遺伝子を活性化できる化合物を最初に同定することができる。これらの化合物はその後、より厳密な分析に供され、特異的な遺伝子活性化特性が確認される。
HTSによる最初のヒット化合物の同定に続いて、より詳細なバリデーション法を用いて、活性化因子としての能力を確認する。定量的PCR(qPCR)はそのような確認技術の一つで、候補化合物に曝露した後のA030009H04Rik遺伝子のmRNA発現レベルを測定する。暴露後に遺伝子のmRNA転写産物の増加が観察された場合、その化合物が転写の段階で遺伝子発現を増強できることを示している。qPCRに続いて、ウェスタンブロット分析を用いて、mRNAレベルの上昇がタンパク質発現の増加につながるかどうかを判定する。この技術では、細胞タンパク質を電気泳動で分離し、膜に移し、A030009H04Rikタンパク質に特異的な抗体でプローブする。ウェスタンブロット上で、対照条件と比較してタンパク質の存在が増加すれば、その化合物が遺伝子を活性化する能力があることが確認され、mRNA合成レベルから最終的なタンパク質発現に至るまで、遺伝子の活性が真に増強されていることを意味する。これらの方法は総体として、A030009H04Rik遺伝子の活性化因子としての化合物の活性を検証するための構造化された信頼性の高いアプローチを提供し、観察された効果が遺伝子の動作発現の真の増加によるものであることを保証する。
関連項目
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製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
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IBMX | 28822-58-4 | sc-201188 sc-201188B sc-201188A | 200 mg 500 mg 1 g | $159.00 $315.00 $598.00 | 34 | |
IBMXはホスホジエステラーゼの非選択的阻害剤であり、cAMPの分解を防ぎ、PKA活性を増加させる可能性があり、フォルスコリンと同様のメカニズムによりA030009H04Rikの活性を高めます。 | ||||||
PMA | 16561-29-8 | sc-3576 sc-3576A sc-3576B sc-3576C sc-3576D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 100 mg | $40.00 $129.00 $210.00 $490.00 $929.00 | 119 | |
PMAはプロテインキナーゼC(PKC)を活性化し、A030009H04Rikと相互作用するタンパク質のリン酸化につながり、間接的にその活性を高めると考えられる。 | ||||||
Ionomycin | 56092-82-1 | sc-3592 sc-3592A | 1 mg 5 mg | $76.00 $265.00 | 80 | |
イオノマイシンはカルシウムイオンフォアであり、細胞内カルシウムレベルを上昇させ、カルシウム依存性キナーゼを活性化してA030009H04Rikまたはその関連タンパク質をリン酸化し、それによってその活性を強化する可能性があります。 | ||||||
A23187 | 52665-69-7 | sc-3591 sc-3591B sc-3591A sc-3591C | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg | $54.00 $128.00 $199.00 $311.00 | 23 | |
A23187は、イオノマイシンと似たメカニズムを持つもう一つのカルシウムイオノフォアで、カルシウム依存性のシグナル伝達経路を調節することによってA030009H04Rikの活性を増強する可能性がある。 | ||||||
LY 294002 | 154447-36-6 | sc-201426 sc-201426A | 5 mg 25 mg | $121.00 $392.00 | 148 | |
LY294002はPI3K経路の阻害剤であり、競合的シグナル伝達を減少させることによってA030009H04Rikの活性を正に制御する下流エフェクターの活性化につながる可能性がある。 | ||||||
U-0126 | 109511-58-2 | sc-222395 sc-222395A | 1 mg 5 mg | $63.00 $241.00 | 136 | |
U0126はMEKの阻害剤であり、MAPK経路を介したシグナル伝達を減少させることにより、A030009H04Rikの活性を増強する方向にシグナル伝達経路をシフトさせる可能性がある。 | ||||||
SB 203580 | 152121-47-6 | sc-3533 sc-3533A | 1 mg 5 mg | $88.00 $342.00 | 284 | |
SB203580はp38 MAPK阻害剤であり、シグナル伝達をA030009H04Rikに関連する経路に方向転換することにより、A030009H04Rikの活性を増強する可能性がある。 | ||||||
D-erythro-Sphingosine-1-phosphate | 26993-30-6 | sc-201383 sc-201383D sc-201383A sc-201383B sc-201383C | 1 mg 2 mg 5 mg 10 mg 25 mg | $162.00 $316.00 $559.00 $889.00 $1693.00 | 7 | |
スフィンゴシン-1-リン酸はスフィンゴシンキナーゼを活性化し、スフィンゴシン-1-リン酸レセプターを介したA030009H04Rikの活性化を含むシグナル伝達を引き起こす。 | ||||||
Genistein | 446-72-0 | sc-3515 sc-3515A sc-3515B sc-3515C sc-3515D sc-3515E sc-3515F | 100 mg 500 mg 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g | $26.00 $92.00 $120.00 $310.00 $500.00 $908.00 $1821.00 | 46 | |
ゲニステインはチロシンキナーゼ阻害剤であり、競合的なキナーゼシグナル伝達を減少させることによってA030009H04Rikの活性を増強し、A030009H04Rikに関連する経路をより活性化させる可能性がある。 | ||||||
(−)-Epigallocatechin Gallate | 989-51-5 | sc-200802 sc-200802A sc-200802B sc-200802C sc-200802D sc-200802E | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g 10 g | $42.00 $72.00 $124.00 $238.00 $520.00 $1234.00 | 11 | |
キナーゼ阻害剤であるエピガロカテキンガレートは、A030009H04Rikに関連する経路を負に制御するキナーゼを阻害することによって、間接的にA030009H04Rikの活性を増強する可能性がある。 |