A030007L17Rik活性化剤は、A030007L17Rik遺伝子の活性を増強することができる化合物の一群を表す。このような活性化因子の同定には、まずハイスループットスクリーニング(HTS)が必要である。このアプローチは、大量の化学物質ライブラリーの中から、遺伝子活性に望ましい影響を与えるものをピンポイントで探し出すために極めて重要である。具体的には、A030007L17Rikプロモーターが検出可能なレポーター遺伝子の発現を制御するレポーター遺伝子アッセイが設定される。レポーター遺伝子は通常、活性化により蛍光や発光などの測定可能なシグナルを発生するタンパク質をコードする。この系に様々な化学化合物を導入すると、プロモーターの活性をアップレギュレートできるものは、より高いレポーターシグナルをもたらす。レポーター活性の有意な上昇をもたらす化合物は、A030007L17Rik遺伝子の潜在的活性化因子としてフラグが立てられる。これらの候補分子は、遺伝子活性化の可能性を検証するため、さらなる確認試験にかけられる。
ハイスループット・スクリーニングによって有望な化合物が同定されると、次のステップでは定量的PCR(qPCR)による検証が行われる。この技術は、化学活性化剤の存在下でのA030007L17Rik mRNAの発現レベルを正確に定量するために採用される。mRNAレベルの増加は、化学物質が転写レベルで遺伝子を活性化できることを示唆する。mRNAの増加がタンパク質発現の増加に対応していることを確認するために、ウェスタンブロット分析が行われる。これは、細胞タンパク質をゲル電気泳動で分離し、膜に転写し、A030007L17Rikタンパク質に特異的な抗体でプローブすることを含む。未処理のコントロールと比較して、検出されたタンパク質レベルが目に見えて増加すれば、遺伝子を活性化する化合物の有効性が確認され、タンパク質産物のアップレギュレーションが成功したことになる。これらの方法は、mRNAレベルで観察された遺伝子の活性化と最終的なタンパク質の産生との間の直接的なリンクを確立し、活性化因子としての化学物質の役割の確実な確認を提供する。
関連項目
製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
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PMA | 16561-29-8 | sc-3576 sc-3576A sc-3576B sc-3576C sc-3576D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 100 mg | $40.00 $129.00 $210.00 $490.00 $929.00 | 119 | |
PMAはプロテインキナーゼC(PKC)の活性化因子である。PKCは多くの標的タンパク質のセリンおよびスレオニン残基をリン酸化する。もし「A030007L17Rik」がPKCによって制御される経路の一部であるか、あるいはセリン/スレオニンリン酸化部位を持つ場合、PMAはこのメカニズムを介してその機能活性を増強する可能性がある。 | ||||||
Ionomycin | 56092-82-1 | sc-3592 sc-3592A | 1 mg 5 mg | $76.00 $265.00 | 80 | |
イオノマイシンは細胞内カルシウム濃度を増加させるカルシウムイオンフォアである。カルシウムは多くのシグナル伝達経路におけるセカンドメッセンジャーであり、カルモジュリン依存性キナーゼ(CaMK)などのカルシウム依存性キナーゼを活性化することができる。「A030007L17Rik」がCaMKによって活性化されるか、あるいはカルシウム制御経路の一部である場合、イオノマイシンはその活性を増強する可能性がある。 | ||||||
(−)-Epigallocatechin Gallate | 989-51-5 | sc-200802 sc-200802A sc-200802B sc-200802C sc-200802D sc-200802E | 10 mg 50 mg 100 mg 500 mg 1 g 10 g | $42.00 $72.00 $124.00 $238.00 $520.00 $1234.00 | 11 | |
EGCGは特定の種類のキナーゼを阻害することが知られています。「A030007L17Rik」がEGCGによって阻害されるキナーゼによって負に制御されている場合、そのキナーゼの阻害は、阻害性リン酸化を除去することで間接的に「A030007L17Rik」の活性を増加させる可能性があります。 | ||||||
Lithium | 7439-93-2 | sc-252954 | 50 g | $214.00 | ||
塩化リチウムは、グリコーゲン合成酵素キナーゼ-3(GSK-3)を阻害する。GSK-3の阻害は、特にβカテニンが関与するシグナル伝達経路の活性化につながる可能性がある。「A030007L17Rik」がWnt/βカテニン経路の一部である場合、リチウムはGSK-3を阻害することで間接的に「A030007L17Rik」を活性化する可能性がある。 | ||||||
Okadaic Acid | 78111-17-8 | sc-3513 sc-3513A sc-3513B | 25 µg 100 µg 1 mg | $285.00 $520.00 $1300.00 | 78 | |
オカダ酸は、タンパク質ホスファターゼ PP1 および PP2A の強力な阻害剤です。これらのホスファターゼを阻害すると、タンパク質の脱リン酸化が妨げられ、リン酸化状態が強化される可能性があります。A030007L17Rik は仮の名称であり、特定の活性化因子や経路に関する直接的な情報は入手できないため、一般的なタンパク質と相互作用したり、それを活性化したりする可能性のある既知の細胞メカニズムに基づく論理的な分析を続けます。 |