ACTL11阻害剤には、主に細胞内の細胞骨格ネットワークを標的とする様々な化合物が含まれる。このネットワークは、形状維持、細胞内輸送、細胞分裂など、多くの細胞プロセスに必須である。ACTL11タンパク質はアクチンと類似しており、これらのプロセスに関与している可能性が高い。従って、細胞骨格を破壊する化学物質は、間接的にACTL11の機能に影響を与える可能性がある。Cytochalasin D、Latrunculin A、Swinholide Aなどの化合物は、アクチンまたはアクチン関連タンパク質に直接結合し、アクチンフィラメントの重合と安定性を阻害する。これにより細胞骨格の構造的完全性が変化し、ACTL11とアクチンとの相互作用が阻害される可能性がある。ジャスプラキノライドは逆にアクチンフィラメントを安定化させるが、その結果、正常な細胞骨格の動態が阻害され、ACTL11の機能にも影響を及ぼす可能性がある。
ML-7やY-27632のような阻害剤は、それぞれミオシン軽鎖キナーゼやRho-associated protein kinase(ROCK)のようなアクチン細胞骨格を制御するタンパク質のリン酸化状態や活性に影響を与える。これらの制御機構を変化させることにより、これらの化合物はACTL11の細胞骨格環境を変化させることができる。それぞれミオシンIIとArp2/3複合体を標的とするBlebbistatinとCK-666もまた、細胞骨格構造に影響を与え、その結果ACTL11の細胞骨格内での役割に影響を与えることができる。さらに、ホルミンを介したアクチン集合体を標的とするSMIFH2は、ACTL11が会合するアクチン構造の構成に影響を及ぼす可能性がある。最後に、Colchicine、Nocodazole、Paclitaxelのような微小管に作用する薬剤は、主にチューブリン動態を標的とするが、微小管とアクチンフィラメントの相互作用を変化させることにより、間接的にACTL11に影響を与える細胞環境を作り出す可能性がある。
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