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USF-1 CRISPR Activationプラスミド (m) | sc-423628-ACT | 20 µg | $397.00 |
Upstream stimulatory factor 1(Usf1)は、USF-1転写因子をコードしている。USF-1は塩基性ヘリックス・ループ・ヘリックス(bHLH)—ロイシンジッパー型タンパク質で、E-boxモチーフに結合し、細胞代謝・分化・ストレス応答を制御する遺伝子発現プログラムを統合的に調節する。マウス細胞においてUSF-1は、栄養およびホルモンシグナルを統合して、脂質・グルコース恒常性、ミトコンドリア機能や酸化関連経路、ならびに概日リズムに関連した転写ネットワークを制御する。プロモーターおよびエンハンサー領域での活性を介して、USF-1は代謝組織や免疫に関連する状況においてクロマチンのアクセシビリティと転写出力に広範な影響を及ぼす。USF1/USF-1活性の破綻は、リポタンパク質の取り扱い異常やインスリン感受性の変化などを含む心代謝系表現型と関連づけられており、代謝疾患の生物学を解明する機構研究における有用な標的となる。
USF-1 CRISPR活性化プラスミド(m)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性Usf1の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
USF-1 CRISPR 活性化プラスミド (m) は、ヒト細胞株における Usf1 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はUsf1転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性USF-1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のUsf1遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるUSF-1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびUsf1発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるUSF-1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。