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TTF/Transcription Termination Factor/TTF1 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-407927-ACT | 20 µg | $397.00 |
TTF1(転写終結因子1)は核小体に局在するDNA結合タンパク質で、rRNA遺伝子の転写終結を促進し、rDNAクロマチン構造を編成することで、RNAポリメラーゼIによる転写を制御します。転写終結、複製フォークバリア、核小体アーキテクチャを制御することにより、TTF1はリボソーム生合成、ゲノム安定性、ならびに細胞周期に伴う増殖プログラムに寄与します。TTF1依存的な過程に関連するrDNA転写の攪乱や核小体ストレス応答は、がん関連生物学における増殖制御の破綻やプロテオスタシスの変化としばしば結び付いています。そのためTTF1は、ヒト細胞における核小体機能、rDNAリピートの制御、転写と複製の協調を研究するうえで有用な結節点となります。
TTF/Transcription Termination Factor/TTF1 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性TTF1の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
TTF/Transcription Termination Factor/TTF1 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における TTF1 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はTTF1転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性TTF/Transcription Termination Factor/TTF1の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のTTF1遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるTTF/Transcription Termination Factor/TTF1依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびTTF1発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるTTF/Transcription Termination Factor/TTF1経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。