TREX-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-423502

概要

Trex1 は、3′→5′DNA エキソヌクレアーゼである TREX-1 をコードしており、内在性レトロエレメント、複製ストレス、または DNA 損傷に由来する異常な細胞質内 DNA を分解することで、自然免疫センサーの不適切な活性化を抑制します。TREX-1 は cGAS–STING シグナル伝達および下流の I 型インターフェロン転写プログラムを抑えることで免疫恒常性の維持に寄与し、自己核酸に対する慢性的な炎症反応を防ぎます。マウス系では、Trex1 欠損は核酸駆動性自己炎症のモデルとして広く用いられ、ゲノム不安定性、細胞死経路、インターフェロン刺激遺伝子発現を結び付ける機構の解明に利用されます。TREX-1 活性は DNA 修復や複製関連プロセスとも交差するため、遺伝毒性ストレスや免疫監視の研究においても重要です。

TREX-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるTrex1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Trex1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Trex1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、TREX-1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、TREX-1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Trex1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• TREX-1の機能に不可欠なTrex1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Trex1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• TREX-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびTREX-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Trex1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  TREX-1 HDRプラスミド（m）および TREX-1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはTrex1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のTrex1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。