TFIIE-α Double Nickaseプラスミド (h): sc-404654-NIC
- 対象生物種: human
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- TFIIE-α Double Nickaseプラスミド (h)はペアのプラスミドを含みます。それぞれのプラスミドはD10A変異したCas9 nuclease、及びCRISPR/Cas9 KOの対応よりも高い特異性で遺伝子発現をノックアウトするように設計された標的特異的な20 ntガイドRNA (gRNA)をコードします。
- ペアリングしたガイドRNAは、約20 bpでずらすことにより、ゲノムDNAの特定Cas9媒介のdouble nickingを可能にし、DSBを模造します。
- ペアの1つのプラスミドは選択用のピューロマイシン耐性遺伝子を含みます；ペアのほかの1つのプラスミドは、視覚的にトランスフェクションを確認するGFPマーカーを含みます。
- TFIIE-αダブルニカースプラスミド（h）およびTFIIE-αダブルニカースプラスミド（h2）は、GTF2E1を標的とする異なるペアのgRNA設計をコードしています。いずれか一方、あるいは両方のデザインが利用可能である場合があります
- トランスフェクションの後、遺伝子ノックアウト効果は、抗体を用いたWB、IFまたはIHCによって検定されることができます: TFIIE-α 抗体 (E-2): sc-133064
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
TFIIE-α Double Nickaseプラスミド (h) | sc-404654-NIC | 20 µg | $410.00 | |||
TFIIE-α Double Nickaseプラスミド (h2) | sc-404654-NIC-2 | 20 µg | $410.00 |
GTF2E1は、転写因子IIE（TFIIE）のαサブユニット（TFIIE-α）をコードしており、正確な転写開始点の選択に必要なRNAポリメラーゼII前初期複合体の必須構成要素である。TFIIEはTFIIFおよびTFIIHと協調してプロモーターの開裂（オープン化）と転写開始を促進し、GTF2E1をPol II依存的転写に基づく中核的な遺伝子発現プログラムや細胞応答と結び付けている。基礎転写の調節における役割を通じて、TFIIE-αは細胞周期の進行、分化、ストレス適応的な転写リモデリングなどの過程に影響を及ぼす。一般転写機構の破綻は発生異常やがんに関連する転写依存性に関与するとされており、GTF2E1は転写制御の機構研究に有用な結節点（ノード）となる。
TFIIE-α ダブルニカースプラスミド（h）は、human 細胞株における GTF2E1 座の高特異性編集のために設計された、対となる2つのプラスミドから構成される。各プラスミドは、Cas9 D10Aニカースと、GTF2E1内の対向するDNA鎖を標的とする異なるsgRNAを発現する。対向するDNA鎖上の隣接する部位に誘導されると、2つのニカースはオフセットした一本鎖切断を生成し、これらが組み合わさってずれた二本鎖切断を生じさせる。これにより、両方のガイドによる協調的なオンターゲット活性が必要となる。生じたDNA切断は、細胞内の内在性修復経路、特に非相同末端結合（NHEJ）によって修復され、その結果、GTF2E1の機能を阻害する挿入または欠失が生じる。標的座標における2つのsgRNAの結合を必要とするこの二重ニッキング法は、編集の特異性を高め、標的精度に対するさらなる制御が求められる用途において、CRISPR戦略を補完するものである。
編集された細胞を効率的に同定するために、1つのプラスミドはトランスフェクトされた細胞集団を蛍光可視化するためのGFPをコードし、もう1つのプラスミドは抗生物質選別用のプロマイシン耐性遺伝子を保有しています。これらの機能により、共トランスフェクトされた細胞集団の効率的な濃縮が可能となり、GTF2E1が破壊されたクローンの検証が簡素化されます。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。