Sox-21 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406354

Panoramica

SOX21 codifica il fattore di trascrizione Sox-21, una proteina legante il DNA con dominio HMG (high-mobility group) box che regola l’impegno di linea e i programmi di differenziamento nei tessuti ectodermici e neurali. Sox-21 partecipa a reti trascrizionali che intersecano le vie di segnalazione Notch e Wnt e può modulare l’equilibrio tra mantenimento dei progenitori e maturazione neuronale attraverso la repressione o l’attivazione genica dipendente dal contesto. Durante lo sviluppo contribuisce alla specificazione del destino cellulare e al patterning dei tessuti, rendendolo un nodo utile per studiare il controllo trascrizionale della neurogenesi e della differenziazione epidermica. Un’espressione deregolata di SOX21 è stata riportata in molteplici tipi di tumore e in stati di differenziamento aberranti, a supporto dell’indagine dei suoi ruoli nei programmi trascrizionali oncogenici e nelle transizioni di stato cellulare.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-21 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene SOX21 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del SOX21 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto SOX21 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina Sox-21.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di SOX21 per lo studio della segnalazione di Sox-21, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni SOX21 critici per la funzione di Sox-21
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di SOX21 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal Sox-21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal Sox-21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus SOX21. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal Sox-21 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR Sox-21 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia SOX21 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio SOX21 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.