SNX5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-404660

概要

ヒトSNX5（sorting nexin 5）は、PXドメインを含むエンドソーム局在タンパク質をコードしており、ホスホイノシチドに結合するとともに、膜リモデリング因子と協調してカーゴの選別および小胞輸送を制御します。SNX5は、エンドソームからゴルジ体への輸送経路やエンドソームリサイクリング経路に関与し、膜貫通タンパク質の細胞内局在を調節することで、受容体のターンオーバーやシグナル減衰を支えます。さらに、エンドソームのチューブ形成やタンパク質複合体のアセンブリにおける役割を通じて、受容体介在性シグナル伝達、栄養取り込み、膜組成といった細胞恒常性に関わるプロセスに影響を及ぼします。ソーティングネキシンが関与するエンドソーム輸送経路の変化は、増殖因子シグナルの異常や細胞ストレス応答の破綻と関連することが知られており、SNX5は疾患関連の輸送異常の機構研究において重要な対象となります。

SNX5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるSNX5遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、SNX5内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、SNX5のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、SNX5タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、SNX5シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、SNX5欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• SNX5の機能に不可欠なSNX5エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、SNX5ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• SNX5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびSNX5 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、SNX5遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  SNX5 HDRプラスミド（h）および SNX5 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはSNX5ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のSNX5標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。